Während Jedi-Generäle wie Anakin Skywalker die Große Armee der Republik in die Schlacht führen, sorgen Klontruppen dafür, dass sie mit maximaler Effizienz weiterläuft. Einige Klone kombinieren sogar die Waffenfertigkeit und die genetische Vorlage, die alle Klone gemeinsam haben, mit einer weiteren speziellen Ausbildung in Bereichen wie Kommunikation und Technik, um die Operationen der Republik vor Ort zu unterstützen.
 
Mit dieser Erweiterung stehen Ihnen vier Klonspezialisten zur Verfügung, mit denen Sie die Personalplätze Ihrer Einheiten auf neue Weise füllen können. Darüber hinaus kann der in dieser Erweiterung enthaltene Klonkommandant eine einzelne Einheit oder Ihre gesamte Armee führen, und drei neue Befehlskarten, die von jedem republikanischen Kommandanten verwendet werden können, eröffnen eine Vielzahl neuer strategischer Optionen.